在探讨这个问题之前，我们需要明确几个概念和法律规定。首先，什么是“违纪”行为？其次，什么是“工伤认定”？最后，我们还需要了解《工伤保险条例》的相关规定。

1. 违纪行为的界定： 违纪行为通常是指违反单位规章制度的行为，例如迟到、早退、旷工等。这些行为可能会导致纪律处分或者被解雇的后果。然而，需要注意的是，违纪行为并不一定与工作有关，因此不一定影响工伤认定的结果。

2. 工伤认定的定义： 根据《工伤保险条例》第十四条的规定，职工有下列情形之一的，应当认定为工伤：（一）在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害的；（二）工作时间前后在工作场所内，从事与工作有关的预备性或者收尾性工作受到事故伤害的；（三）在工作时间和工作场所内，因履行工作职责受到暴力等意外伤害的；（四）患职业病的；（五）因工外出期间，由于工作原因受到伤害或者发生事故下落不明的；（六）在上下班途中，受到非本人主要责任的交通事故或者城市轨道交通、客运轮渡、火车事故伤害的；（七）法律、行政法规规定应当认定为工伤的其他情形。

3. 企业的权利和义务： 企业在面对员工的工伤申请时，应该积极配合相关部门进行调查和提供证据。如果员工确实是在工作时间内因为工作的原因受伤，那么即使存在违纪行为，也应该依法认定为工伤。但是，如果员工的受伤是因为其故意犯罪、醉酒或吸毒、自残或自杀等原因造成的，则不应认定为工伤。

4. 相关案例分析： 在实践中，曾经有过这样的案例：某公司的一名员工在工作中违反了公司的安全操作规程，导致了受伤。尽管该员工存在违纪行为，但经过调查发现，其受伤是由于工作中所面临的危险因素所致，而非完全因其个人过失造成。最终，法院判决认定了这名员工的工伤请求。从这个案例可以看出，即便员工存在违纪行为，但如果其受伤符合工伤认定的条件，仍然可以被认定为工伤。

综上所述，虽然违纪行为可能影响到员工的绩效考核和岗位稳定性，但它并不是拒绝工伤认定的合法理由。只要员工的受伤满足《工伤保险条例》中规定的条件，就应该被认定为工伤，无论他们是否在工作中存在违纪行为。这是为了保护劳动者的合法权益，同时也是社会公平正义的体现。